Akvārija ūdens kondicionieris izmantošanai saldūdens akvārijos tipiskām baktēriju infekcijām, piemēram, kalumnariozei, spuras puvei, žaunu puvei un infekcijām, ko izraisa baktērijas Aeromonas vai Pseudomonas.
Lai novērstu sekundāras infekcijas bojātajās ādas vietās. Kondicionieri var izmantot arī ārstēšanai pret ektoparazītiem, piemēram, zivju dēles, zivju utīm vai parazītu vēžveidīgajiem uz žaunām.